Вы совершенно правы, существуют два варианта исполнения системы молниезащиты, это внешняя, которая полностью перехватывает электрический разряд и отводит его к земле. И вторая внутренняя, которая защищает всё электрооборудование в здании от перенапряжения в сети из-за разряда молнии. А вообще я вам советую пообщаться с людьми, занимающимися этой самой системой молниезащиты зданий и сооружений, они то помогут вам определиться и посоветуют, что больше подходит вам.Кстати, знаю что в "Алеф-Эм" работают хорошие специалисты в этой области, думаю они вам помогут, вот сайт
http://www.groze.net/info/doc.html